MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN2

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017480	ACC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017480	GTT	2	6	117	122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017480	CCA	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017480	AGT	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017480	TTG	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017480	CAT	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017480	AGCT	2	8	461	468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017480	TTG	2	6	490	495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017480	TTGC	2	8	528	535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017480	TGC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017480	CTG	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017480	TAG	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017480	ATTC	2	8	2175	2182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017480	TCGCT	2	10	2205	2214	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017480	CTG	2	6	2219	2224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017480	ATTA	2	8	2315	2322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017480	TA	4	8	2321	2328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017480	AGG	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017480	AAG	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017480	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017480	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017480	A	6	6	2516	2521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017480	GTG	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017480	AGCA	2	8	2610	2617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017480	GAA	2	6	2777	2782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017480	A	6	6	2833	2838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017480	TCAT	2	8	2882	2889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017480	T	6	6	2965	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017480	TTC	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017480	T	6	6	3007	3012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017480	ATA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017480	TCT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017480	CCG	2	6	3887	3892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017480	TGC	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017480	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017480	TTGGT	2	10	3965	3974	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017480	TGG	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017480	T	6	6	5393	5398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017480	AAC	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017480	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017480	T	6	6	5621	5626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017480	GTT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017480	AAT	2	6	5656	5661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017480	ATTA	2	8	5734	5741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017480	AAAT	2	8	5745	5752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017480	ATT	2	6	5763	5768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017480	AGC	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017480	CTT	2	6	5915	5920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017480	A	6	6	5938	5943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017480	TCTT	2	8	5956	5963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017480	TTC	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017480	T	8	8	6009	6016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017480	TTA	2	6	6058	6063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017480	TTG	2	6	6069	6074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017480	GTTTT	2	10	6108	6117	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017480	TTG	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017480	TTG	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017480	A	7	7	7596	7602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017480	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017480	A	6	6	7689	7694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017480	TAC	2	6	7695	7700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017480	GAC	2	6	7719	7724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017480	AC	3	6	7723	7728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017480	AGT	2	6	7748	7753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017480	GAGT	2	8	7792	7799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017480	CTC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017480	ATT	2	6	7823	7828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017480	TGTGGG	2	12	7849	7860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017480	AAAT	2	8	7952	7959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017480	A	6	6	7971	7976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017480	AAT	2	6	7985	7990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017480	ATT	3	9	8028	8036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017480	GAA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017480	TTGA	2	8	8100	8107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017480	TGA	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017480	AAG	2	6	8984	8989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017480	TG	4	8	9488	9495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017480	TTC	2	6	9538	9543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017480	AGG	2	6	9597	9602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017480	AGA	2	6	9618	9623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017480	AATC	2	8	10555	10562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017480	TGG	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017480	GGTT	2	8	10634	10641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017480	T	6	6	10661	10666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017480	CAAA	2	8	10675	10682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017480	ATC	2	6	10722	10727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017480	TGT	2	6	10734	10739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017480	GGT	2	6	10757	10762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017480	GAT	2	6	10763	10768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017480	TAG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017480	TTA	2	6	10803	10808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017480	TTTTG	2	10	11442	11451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017480	TTA	2	6	11481	11486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017480	A	6	6	11492	11497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017480	AGG	2	6	11541	11546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017480	ACA	2	6	11581	11586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017480	TGA	2	6	11625	11630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017480	TGGCA	2	10	12275	12284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017480	ATC	2	6	12297	12302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017480	ATT	2	6	12309	12314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017480	GTT	2	6	12336	12341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017480	GGT	2	6	12428	12433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017480	GCT	2	6	12458	12463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017480	CAA	2	6	12494	12499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017480	CTT	2	6	12539	12544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017480	TTA	2	6	12644	12649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017480	AAT	2	6	12671	12676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017480	TGT	2	6	12679	12684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017480	TAT	2	6	12708	12713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017480	AAG	2	6	12767	12772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017480	ACGA	2	8	12787	12794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017480	ATAA	2	8	12920	12927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017480	AAG	2	6	12940	12945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017480	TCT	2	6	12958	12963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017480	T	6	6	12968	12973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017480	T	6	6	12990	12995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017480	ACC	2	6	13045	13050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017480	TTG	2	6	13146	13151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017480	ATC	2	6	13157	13162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017480	TTC	2	6	13169	13174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017480	AGT	2	6	13228	13233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017480	ATT	2	6	13278	13283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017480	TTCCA	2	10	13315	13324	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017480	TTG	2	6	14208	14213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017480	A	8	8	14232	14239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017480	AATA	2	8	14302	14309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017480	T	7	7	14310	14316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017480	CGT	2	6	14376	14381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017480	CATT	2	8	14400	14407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017480	ATG	2	6	15955	15960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017480	TGA	3	9	15972	15980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017480	TTC	2	6	15994	15999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017480	TGG	2	6	16101	16106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017480	CGG	2	6	16163	16168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017480	CTTA	2	8	16179	16186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017480	TGG	2	6	16301	16306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017480	GAG	2	6	16337	16342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017480	CAT	3	9	16419	16427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017480	TAA	2	6	16479	16484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017480	CTT	2	6	16512	16517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017480	TAC	2	6	16545	16550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017480	TAC	2	6	16571	16576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017480	TAT	2	6	16598	16603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017480	GAT	2	6	16643	16648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017480	GAAA	2	8	16662	16669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017480	ATT	2	6	16744	16749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017480	ATGG	2	8	16761	16768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017480	AGG	2	6	16856	16861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017480	GGACA	2	10	16981	16990	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017480	TTG	2	6	17012	17017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017480	ATT	2	6	17060	17065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017480	GAA	2	6	17082	17087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017480	AAG	2	6	17256	17261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017480	AAT	2	6	17316	17321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_017480	AGT	2	6	17848	17853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017480	TTG	2	6	17967	17972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017480	AACA	2	8	18078	18085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_017480	GCT	2	6	18113	18118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_017480	ATT	2	6	18636	18641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017480	A	6	6	18728	18733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017480	ATT	2	6	18748	18753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017480	AGA	2	6	18913	18918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017480	GAAC	2	8	19053	19060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_017480	ATA	2	6	20242	20247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017480	TCT	2	6	20249	20254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_017480	CGTAAG	2	12	20291	20302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.